Aux XIV et XV siècles Landser et sa seigneurie sont engagées à de multiples reprises par les Habsbourg - qui avaient besoin d'argent - à des seigneurs-gagistes. Le bourg et le château sont menacés ou dévastés plusieurs fois par les conflits qui touchent la région.

Landser et sa région sont particulièrement touchés lors de la guerre de Trente Ans. En 1632-33 Landser est occupé par les Suédois aux ordres du redoutable colonel de Harpf (pillages, destructions, massacres, ...). En 1635 les troupes françaises investissent à leur tour le village et incendient le château qui ne sera pas reconstruit.

Dès 1645 la seigneurie de Landser est donnée par le roi de France aux frères Herwart (banquiers originaires d'Augsbourg) en compensation des avances financières accordées pendant la guerre. Leurs héritiers la conserveront jusqu'à la révolution.

La 2ème moitié du XVIIème siècle correspond à la période de la reconstruction. Progressivement Landser retrouve une véritable prospérité qu'elle conserve pendant tout le XVIIIème siècle. Son rôle de chef-lieu de seigneurie et de bailliage explique la présence d'un personnel administratif nombreux et de beaucoup d'artisans.

Mais la Révolution Française va mettre en cause cette prospérité. Dès les mois de juillet-août 1789, Landser est menacée par la troupe des paysans révoltés du Sundgau. Toute la période révolutionnaire sera particulièrement troublée (notamment en raison des querelles religieuses). Même si Landser reste chef-lieu de canton, le bourg ressort affaibli de cette période (personnel administratif beaucoup moins nombreux que sous l'Ancien Régime).

Ce déclin se poursuit au XIXème siècle. Au déclin administratif se rajoute le déclin économique (baisse de l'activité artisanale et de l'activité commerciale en grande partie en raison de l'éloignement par rapport à l'axe de communication principal Mulhouse-Bâle - route et voie ferrée - qui passe par Habsheim et Sierentz).

Cette situation se maintient dans la 1ère moitié du XXème siècle. Landser devient un simple village à vocation agricole. Cette situation est confirmée par le transfert du chef-lieu de canton à Sierentz en 1948.

Depuis 1970, la construction de nouveaux lotissements a permis le renouveau démographique de Landser, une reprise de l'activité commerciale et un renforcement de son influence au sein du Pays de Sierentz.

Les chroniques rapportent qu'en mars 1496 naquit à Landser un animal monstrueux, un cochon avec une tête mais 2 corps séparés et 8 pattes. 2 éminents artistes de l'époque, frappés par cet événement comme tous leurs contemporains, en ont fait leur source d'inspiration : il s'agit de Sébastien Brant (qui rédigea un poème diffusé sous forme de « feuille volante" surmontée d'une gravure représentant le cochon avec le château de Landser en arrière-plan) et de Albert Dürer (qui a réalisé une petite gravure sur cuivre représentant le cochon monstrueux de Landser).

En février 1633 plusieurs centaines de paysans révoltés qui avaient été faits prisonniers lors de la bataille de Blotzheim quelques jours plus tôt, sont massacrés par les Suédois entre Landser et Steinbrunn. Cet épisode est à l'origine de la légende du « Kuttelrausgraben" au « fossé aux tripes".

En 1929 les pères Salésiens (congrégation fondée au XIXème siècle à Turin par Don Bosco) créèrent à Landser, grâce à une donation de Mme Laillier-Ruell (descendante de la famille Wendling) une école d'agriculture. Transformée en collège d'enseignement secondaire il accueillit dans son internat des jeunes de toute l'Alsace. Aujourd'hui le collège et le lycée Don Bosco accueillent plus de 700 élèves externes et demi-pensionnaires.

Eugène KALT (Landser 1861 - Paris 1941). Fils de Jean-Baptiste KALT, notaire à Landser, Eugène KALT fit des études de médecine à Besançon puis Nancy. De 1889 à sa mort il exerça à la clinique nationale ophtalmologique des Quinze Vingts à Paris. Il fit faire d'importants progrès à la chirurgie oculaire et est considéré comme l'inventeur des lentilles de contact (travaux de 1888).